Para elegir a las marcas de la excelencia, SuperBrands realiza una primera selección entre todas las marcas comerciales individuales que hay en España, cerca de un millón, basándose en criterios de notoriedad, inversión publicitaria, relevancia del sector de actividad, repercusión en medios y conocimiento por parte del consumidor y precios en sus productos, como pasajes aéreos, cremas, etc.
Las 1.300 marcas seleccionadas son valoradas por un consejo de expertos, atendiendo a criterios como la gestión de marca, la lealtad de sus consumidores, el liderazgo que ostentan, valores que definen, según el estudio, a la aerolínea de bandera española Iberia. El consejo de expertos se apoyó un estudio de Reputation Institute cuyo trabajo de campo fue realizado por Netquest durante los meses de diciembre 2012 y enero 2013 entre más de 3.000 consumidores, donde se valoró la reputación de cada una de las marcas seleccionadas. El estudio se basó en parámetros como la confianza, la admiración y la estima, la preferencia sobre otras marcas competidoras, como lo es su par Air Europa con ofertas de vuelos y la recomendación que el consumidor haría de cada marca en su círculo de confianza.