El campeonato Descentralizado 2013 empezará el 10 de febrero y culminará el 8 de diciembre.
Se determinó que los partidos en altura se jueguen a partir de las 3:00 de la tarde y los cotejos en cancha sintética a partir de las 4:00.
Se repetirá el mismo sistema del 2011. Es decir, se disputará en dos etapas (30 fechas) de todos contra todos. Luego se realizará una Liguilla con dos grupos de 8 equipos, ellos serán divididos por su ubicación en la tabla hasta la fecha 30. En una estarán los pares (2, 4, 6, 8, etc.) y en la otra los impares.
Los ganadores de ambas series se enfrentarán en un Play Off para definir al campeón nacional.
Las clasificaciones a los torneos internacionales se decidirán por el puntaje acumulado, tras las 44 fechas a jugarse. En cuanto a la baja, descenderán dos equipos.