Pese a los problemas que atraviesa, la exPontificia Universidad Católica del Perú (PUCP) ocupa el primer lugar en el último ranking web julio 2012 de universidades en Perú, elaborado por el Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) de España, seguida de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos (UNMSM).
De esta forma, la lista fue creada con el propósito de fomentar la competencia y superación entre diversos centros de educación superior en el mundo.
1. Pontificia Universidad Católica del Perú
2. Universidad Nacional Mayor de San Marcos
3. Universidad Peruana Cayetano Heredia
4. Universidad Ricardo Palma
5. Universidad Nacional Agraria La Molina
6. Universidad Los Ángeles de Chimbote
7. Universidad de San Martin de Porres
8. Universidad Católica de Santa María
9. Universidad Nacional de Ingeniería Lima
10. Universidad Peruana de Ciencias Aplicadas
11. Universidad de Piura
12. Universidad ESAN
13. Universidad de Lima
14. Universidad del Pacífico Perú
15. Universidad Peruana Unión
16. Universidad Nacional del Callao
17. Universidad Nacional de San Antonio Abad del Cusco
18. Universidad Católica San Pablo Arequipa
19. Universidad Privada Antenor Orrego
20. Universidad Nacional de la Amazonía Peruana